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L'Atelier 2012

Créneaux ROCHE



 Jeudi 8 novembre 2012: 10h00 - 11h00

 Automatisation de la virologie moléculaire au CHU de Bordeaux

Pr. Hervé FLEURY - Laboratoire de Virologie et Plateau Technique de Biologie Moléculaire - CHU de Bordeaux

Avec environ 30 millions de B pour 17 techniciens, la Virologie bordelaise a du prendre des décisions drastiques sur le choix des techniques et l’organisation interne. La culture et les techniques artisanales (immunofluorescence par exemple) ont été abandonnées au profit de la Biologie Moléculaire. En intégrant des marqueurs d’autres spécialités (Bactériologie, Parasitologie), l’ancienne équipe de Virologie est devenue une équipe d’Infectiologie sur la Plateau Technique de Biologie Moléculaire (PTBM). La recherche de l’automatisation des techniques de PCR en temps réel a été et est une priorité. Dans le cadre de cette organisation, le laboratoire de Virologie a collaboré avec les sociétés Roche, Eppendorf et TIBmolbiol pour la mise en place de deux chaines de Diagnostic Moléculaire de Routine. La société Roche a été maitre d’œuvre sur ce projet, incluant un extracteur MagNA Pure 96 (Roche Diagnostics), un distributeur EpMotion  (Eppendorf ), un système de PCR temps réel  LightCycler 480 (Roche Diagnostics) et des réactifs TIB MOLBIOL avec l’originalité d’un lien informatique entre les appareils dont le résultat final est adressé au système informatique du laboratoire. La chaine 1, opérationnelle pour CMV, HHV6 et EBV, a débuté en routine avant l’été 2012. L’automatisation de la distribution  après extraction est assurée par l’appareil Eppendorf qui dispose de patrons de mise en plaques adaptés au flux de travail prévisionnel du laboratoire. Il y a ainsi de l’extraction au résultat rendu par le Lightcycler 480 une traçabilité de chaque échantillon. Cette solution amène un confort et une sécurité accrue, ainsi qu’une productivité supérieure comparée à l’ancienne organisation.

Ultradeep pyrosequencing en routine pour RT HIV-1: premiers résultats et perspectives

Pr. Hervé FLEURY - Laboratoire de Virologie et Plateau Technique de Biologie Moléculaire - CHU de Bordeaux

A l’issue d’une période de validation d’un  GS Junior Roche (technologie 454) à l’UMR 5234 du CNRS, le CHU de  Bordeaux s’est porté acquéreur de l’équipement . Nous présenterons quelques exemples d’utilisation de la technologie ultradeep pyrosequencing en recherche au niveau de HIV et de HCV. D’autre part, depuis le printemps 2012, l’utilisation du Junior en routine a débuté pour le séquençage de la reverse transcriptase (RT) HIV-1 chez des patients avant initiation d’une HAART. Les résultats obtenus font l’objet d’un compte rendu adressé au clinicien. Nous aborderons ici le contexte de la mise en routine : formation du personnel, cout du séquençage, organisation interne. Nous donnerons des exemples de résultats dont certains sont complexes et posent la question de leur interprétation et de leur gestion en l’absence actuelle de recommandations.  

 Jeudi 8 novembre 2012: 11h30 - 12h30
 
L’apport du Diagnostic in Vitro dans la Médecine Personnalisée

Dr. Frédéric EBERLE - Responsable Médical - Meylan

De tous temps, la médecine personnalisée a représenté un objectif et une exigence partagée par tous les professionnels de santé, se déclinant au niveau thérapeutique selon le principe « administrer le bon médicament, à la bonne dose, à la bonne personne, au bon moment ». Dans ce cadre, parmi les tests de biologie, ceux de pharmacogénétique permettent d’identifier à l’échelon du patient les médicaments a priori source d’effets indésirables, l’antibiogramme et le génotypage HCV représentent des tests prédictifs de réponse individuelle au traitement, et le suivi thérapeutique pharmacologique est par essence personnalisé.

L’atelier présentera les nouveaux biomarqueurs prédictifs de réponse au traitement qui permettent aux cliniciens, parmi plusieurs options thérapeutiques possibles, de sélectionner le traitement optimal à un sous-groupe de patients, tels le génotypage de l’IL28B et les biomarqueurs prédictifs de réponse au rituximab.

Un focus particulier sera fait sur la nouvelle catégorie de tests dénommés « tests-compagnons » qui représentent, en particulier en oncologie, des critères essentiels d’éligibilité aux thérapies ciblées, pour garantir une meilleure efficacité et tolérance du traitement, un meilleur confort de vie, et une augmentation significative de la survie sans progression.

 
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